Il Comitato d'Indirizzo determina l'indirizzo programmatico e gestionale della Riserva e ne controlla l'attuazione; elabora e propone per l'approvazione all'Ente gestore lo Statuto della Riserva e le eventuali modifiche; provvede alla nomina dei componenti la Direzione; delibera sulla definizione di obiettivi, priorità, piani, programmi, interventi, bilancio, piano di gestione e regolamento della Riserva.
Il Comitato attualmente in carica è costituito:
- dal Presidente Sandro Rocchetti e da Giuseppe Marcucci per il Comune di San Benedetto del Tronto,
- dall'Assessore all'Ambiente della Provincia di Ascoli Piceno, Andrea Maria Antonini,
- dall'Assessore all'Ambiente del Comune di Ascoli Piceno, Claudio Sesto Travanti,
- dall'Assessore all'Ambiente della Regione Marche, Sandro Donati.
I componenti del Comitato d’Indirizzo durano in carica quanto gli Organi che li hanno nominati ed esercitano le loro funzioni fino all’insediamento dei rispettivi successori.
